Ryanair se na svých stránkách ohradil vůči zahájení vyšetřování Evropské komise týkající se jeho dohody o využívání
letiště Bratislava. Letiště bylo nejmenovaným subjektem obviněno kvůli možné nezákonné státní pomoci Ryanairu, který prý dostává od letiště slevu 31 % na poplatcích souvisejících s provozem již létaných linek a 48 % pro linky nové. Ryanair vidí za stížností snahu velkých letišť a „drahých“ dopravců co nejvíce ztěžovat expanzi regionálních letišť, rozvoj konkurence a možnost volby cestujících. V souvislosti s podáním zmíněného podnětu Evropské komisi jsou zmiňovány letiště ve Vídni a Austrian Airlines. Vyšetřování v Bratislavě přichází po obdobných žalobách, které se vyšetřovaly ohledně letišť v Tampere (Finsko), Aarhus (Dánsko), Alghero (Itálie), Lübeck (Německo) a Pau (Francie). V současné době se Ryanair odvolává proti rozsudku evropského soudu ve věci belgického Charleroi.
